Установка openFPGAloader

Скорее всего нормальная версия есть в репозиториях вашего дистрибутива, поэтому openFPGAloader можно безболезненно установить оттуда.

Если вдруг вам кажется, что версия устарела и не поддерживает вашу ПЛИС, то у проекта имеется довольно хорошая инструкция по сборке.